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菊粉实际上是多种不同聚合度果聚糖的混合物。其中聚合度较低（DP=2-9）的果聚糖通常称为低聚果糖，聚合度10-30的果聚糖通常称为多聚果糖，聚合度40的果聚糖通常称为高聚果糖。
这就使得菊粉兼有各种果聚糖的保健功效，所以我们称菊粉为复合型多糖或复合型益生元。
水溶性膳食纤维全部被有益菌发酵降解，使有益菌增殖效果非常明显，营养界称：菊粉是有益菌增殖的
菊粉的摄入量：
美国FDA(食品药品管理局）建议每天20-35g
欧盟食品科学推荐每天30g
日本推荐每天20-25g
世界卫生组织推荐每天27-40g
中国推荐每天35g(中国人每天从食物中摄入14g左右),因此建议中国人每天补充10-20g为宜。
菊粉分子约由31个β-D-呋喃果糖和1~2个吡喃菊糖残基聚合而成，果糖残基之间能通过β-2,1-键连接。是由D-果糖经β（1→2）糖苷键链接而成的线性直链多糖，末端常带有一个葡萄糖残基，聚合度（DP）为2~60，其中平均聚合度DP≤9的菊粉又称为短链菊粉，从天然植物中提取的菊粉同时含有长链与短链 [1] 。菊粉的分子式表示为GFn，其中G代表终端葡萄糖单位，F代表果糖分子，n代表果糖的单位数。
干燥的菊粉为白色无定形粉末。通常短链菊粉比长链菊粉易溶于水，菊粉的溶解度会随着温度的升高而明显加大，普通菊粉在10℃的溶解度约为6%，在90℃时约为33%。
短链菊粉含有较多的单糖和双糖，甜度大约相当于蔗糖的30%~50%，普通菊粉略带甜味，约为蔗糖甜度的10%，长链菊粉几乎没有甜味。
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